La programación vigente es: de Asunción a Santiago, martes, jueves y sábados, vuelo #LA1324, sale a las 10:50 y llega a las 13:45; de Santiago a Asunción, martes, jueves y sábados, vuelo #LA1325, sale a las 14:50 y llega a las 17:25. La operación se cubre con aeronaves Airbus A320-200 configuradas con 174 asientos.
Cabe recalcar que la compañía disponía de servicios diarios entre ambas ciudades antes de la pandemia. Posterior a la reapertura de fronteras de los países a fines de 2020, ofrece entre dos a tres vuelos por semana, capacidad que crece o se reduce de acuerdo a la demanda de pasajeros.
LATAM Airlines atiende además al mercado paraguayo con vuelos directos desde Asunción a Lima, Perú; y São Paulo, Brasil; y en código compartido con Paranair, a Buenos Aires, Argentina; y Montevideo, Uruguay.