A continuación la programación prevista entre la capital del país y la segunda localidad en importancia económica del Paraguay comenzando el 13 de febrero de 2023:
Vuelo ZP800: lunes y miércoles, Asunción-CDE, sale 11.30 y llega 12.10; vuelo ZP800: viernes y domingos, Asunción-CDE, sale 15.10 y llega 15.50; vuelo ZP801: lunes y miércoles, CDE-Asunción, sale 12.40 y llega 13.20; vuelo ZP801: viernes y domingos, CDE-Asunción, sale 16.20 y llega 17.00,
Paranair cuenta con una flota de aeronaves Bombardier CRJ-200 de 50 plazas basadas en el aeropuerto internacional Silvio Pettirossi, ubicado en Luque, que vuelan a Ciudad del Este, Buenos Aires, Montevideo y Santa Cruz de la Sierra. Asimismo, la empresa llega a Punta del Este, Florianópolis y Río de Janeiro en temporada de verano.
De momento, Asunción-Ciudad del Este-Asunción es la única ruta comercial doméstica nacional. Anteriormente la desaparecida Sol del Paraguay conectaba a Asunción con Encarnación, pero la misma no reabrió posterior a la pandemia.